Několik překážek musela na počátku překonat stavba jihovýchodní obchvatu Havlíčkova Brodu. Nečekané komplikace se promítly také do původně stanoveného harmonogramu prací. Jezdit po obchvatu by se mělo do konce roku 2023, přičemž podle prvotních plánů to mělo být již v roce 2022. Práce se zpozdily např. kvůli zahnízdění chráněných netopýrů v jedné z lokalit na trase 4,1 km dlouhého obchvatu. Dalí značnou komplikací se ukázala být arsenem kontaminovaná půda způsobená středověkou těžbou stříbra. Znečištění způsobila také ekologické havárii z počátku 80. let minulého století.